Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MGPP08493 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGPP08493 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGPP08493 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGPP08493 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGPP08493 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MGPP08493 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MGPP08493 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms