Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LPLP06858 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LPLP06858 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPLP06858 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPLP06858 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPLP06858 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPLP06858 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPLP06858 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms