Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC1P02654 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC1P02654 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOC1P02654 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC1P02654 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC1P02654 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOC1P02654 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms