Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4FO95754 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4FO95754 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms