Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms