Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNAPINO95295 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNAPINO95295 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNAPINO95295 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms