Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LYPD3O95274 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LYPD3O95274 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms