Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC6O95255 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC6O95255 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC6O95255 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC6O95255 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC6O95255 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC6O95255 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms