Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC1O94876 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms