Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM2O94769 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM2O94769 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM2O94769 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM2O94769 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM2O94769 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM2O94769 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM2O94769 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM2O94769 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms