Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BBOX1O75936 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BBOX1O75936 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms