Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG13O75143 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG13O75143 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG13O75143 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms