Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms