Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD2O60548 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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