Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KIAA0556O60303 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms