Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGTAO43765 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGTAO43765 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGTAO43765 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGTAO43765 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGTAO43765 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGTAO43765 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms