Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNQ3O43525 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
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