Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID2O43424 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID2O43424 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID2O43424 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID2O43424 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID2O43424 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID2O43424 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID2O43424 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID2O43424 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRID2O43424 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRID2O43424 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRID2O43424 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRID2O43424 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms