Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COCHO43405 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COCHO43405 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COCHO43405 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COCHO43405 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COCHO43405 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COCHO43405 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COCHO43405 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COCHO43405 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COCHO43405 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COCHO43405 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms