Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI2O43237 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI2O43237 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 545.7 ms