Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOCS1O15524 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS1O15524 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms