Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCAO15360 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCAO15360 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCAO15360 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FANCAO15360 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
FANCAO15360 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FANCAO15360 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
FANCAO15360 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FANCAO15360 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
FANCAO15360 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms