Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK1O15075 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLK1O15075 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms