Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PODXLO00592 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PODXLO00592 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PODXLO00592 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXLO00592 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXLO00592 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXLO00592 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms