Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN5O00501 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms