Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF103O00237 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF103O00237 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF103O00237 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF103O00237 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF103O00237 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF103O00237 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms