Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C0C1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C0C1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C0C1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C0C1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C0C1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C0C1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C0C1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C0C1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms