Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A8MVJ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A8MVJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A8MVJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A8MVJ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A8MVJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A8MVJ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms