Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms