Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6L3A6NEY3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6L3A6NEY3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms