Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSDA5PKW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms