Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMX2A2RU54 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms