Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POTEB3A0JP26 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POTEB3A0JP26 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POTEB3A0JP26 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms