Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms