Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQJ8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQJ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms