Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAMTA1Q9Y6Y1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms