Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms