Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX8Q9Y5X2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX8Q9Y5X2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms