Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB12Q9Y5F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms