Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP15Q9Y4E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP15Q9Y4E8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms