Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms