Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP3Q9Y446 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP3Q9Y446 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms