Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAN1Q9Y2M0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms