Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP20Q9Y2K6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP20Q9Y2K6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms