Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM50BQ9Y247 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM50BQ9Y247 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM50BQ9Y247 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms