Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD1AQ9Y241 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms