Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX12Q9UMY4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms