Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP18Q9UMW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP18Q9UMW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
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