Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF3Q9ULD4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BRPF3Q9ULD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF3Q9ULD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF3Q9ULD4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF3Q9ULD4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF3Q9ULD4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms