Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
PNMA2Q9UL42 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA2Q9UL42 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms